KELAS SAINS IPA- OLIMPIADE merupakan kelas dari program IPA Unggulan di MA Al Hikmah 2 atau yang sering dikenal sebagai IPA IMERSI. Fokus pembelajarannya adalah menyiapkan siswa-siswi Malhikdua bersaing di bidang Sains dan Teknologi dan sebagai duta sekolah dalam mengikuti berbagai jenis perlombaan olimpiade sains baik di tingkat Kabupaten, Provinsi, Nasional maupun Internasional. Kelas Sains IPA -Olimpiade juga menyiapkan lebih khusus siswa-siswinya untuk mendapatkan kursi di PTN – PTN ternama di Indonesia. Beberapa yang perlu diketahui dari kelas ini yaitu:

1. Menyiapkan siswa yang memiliki kompetensi keilmuan standar nasional
2. Menyiapkan duta MA Al Hikmah 2 dalam semua ajang kompetisi akademik
3. Menyiapkan lulusan untuk melanjutkan ke jenjang PT terbaik di tanah air : UI, UGM, ITB, UNAIR, BRAWIJAYA, ITS, IPB, dll.
4. Sebagai awal program dikhususkan untuk kelas IPA
5. Jumlah maksimal siswa 32 anak yang diseleksi secara khusus
6. Struktur program mata pelajaran berbeda dengan program regular
7. Program pengelolaan keuangan dilakukan secara khusus
8. Guru-guru pengampu diseleksi secara khusus sehingga memungkinkan guru dari sekolah lain
9. Diadakan subsidi silang bagi siswa yang berprestasi
10. Kalender akademink tidak mengikuti kalender akademik program regular
11. Sekolah menyediakan fasilitas pembelajaran yang standard an sarana pengembangan diri sesuai pilihan terutama berkaitan dengan kegiatan ilmiah
12. Peserta program khusus secara otomatis mengikuti program bahasa Inggris (Intrakulikuler) sehingga standar terakhirnya adalah tes TOEFL.
13. Struktur program
    1. Matematika
    2. Fisika
    3. Kimia
    4. Biologi
    5. Bahasa inggris
    6. Bahasa Indonesia
    7. Aqidah Akhlak Pesantren
    8. Fiqih Pesantren
    9. Al-Qur’an (Tahsin, tajwid, dan Tahfidz)
    10. Character Building
    11. Teknologi Informasi
14. Semua siswa program khusus diikutkan PBUD, PBUTM, PBUP, dan seleksi beasiswa Kemenag
15. Menempati kamar khusus
16. Ruang kelas khusus

TUJUAN

1. Menyiapkan siswa yang lurus dalam akidah, benar dalam syariah, dan mulia dalam berakhlak
2. Menyiapkan siswa memiliki kompetensi sains dan teknologi ditandai dengan perolehan nilai di atas rata-rata pada mapel mafikib Menyiapkan duta MA Alhikmah 2 dalam semua ajang

LULUSAN

1. Mutadayyin (Komitmen terhadap agama)
2. Memiliki nilai tinggi pada mapel Mafikib
3. Menjadi juara lomba sains dan Teknologi Diterima di PTN favorit atau Jurusan Favorit